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使用nohup后台运行Mothur命令

发布于:17-11-14  |   作者:admin

最常用的16s rRNA分析软件Mothur,使用方便好用。mothur能够在mac、windows和unix系统运行,甚至已经有GUI版本。但是在unix系统上运行还是主流。这里分享mothur和nohup

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标签: 日志分类:学习笔记围观群众:94人
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scipy安装错误:cannot import name NUMPY_MKL

发布于:17-10-12  |   作者:admin

安装scipy后,import时出现错误 安装环境:windows 10 和python2.7.14 错误提示:from numpy._distributor_init import NUMPY_MKL # requires numpy+mkl ImportError: cannot import name NUMPY_MKL 解决方案:1. 下载编译的numpy+MKL和编译的scipy, 点击此

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标签:scipy,python 日志分类:Python围观群众:186人
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python多进程变成Multiprocessing

发布于:17-10-04  |   作者:admin

一 apply(func[, args[, kwds]]) apply用于传递不定参数,同python中的apply函数一致(不过内置的apply函数从2.3以后就不建议使用了),主进程会阻塞于函数。 for x in gen_list(l): result = pool.apply(pool_test, (x,)) print main process 这个时候主进程

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标签: 日志分类:Python围观群众:149人
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windows下安装numpy和scipy

发布于:17-08-28  |   作者:admin

numpy和scipy是科学计算常用的python包,我之前多次安装都不太顺利。换了win10系统之后首次安装,依然错误多多,困难重重。直接使用pip install scipy安装各种错误,不知道是不是因为pypi库没有匹配windows系统的轮子。但是搜索意外发现,在加州大学域名下的

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标签:numpy,scipy,python 日志分类:Python围观群众:264人
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MD5生成器分享,上传数据到NCBI SRA数据库必备软件

发布于:17-07-25  |   作者:admin

为了上传数据到NCB,不得不下载MD5生成器这种小众软件,结果,多年老司机在找MD5生成器这种小软件上翻了车。下载到带病毒的软件,导致电脑罢工半天。最终找到这个亲测可用的软件。考虑到上传数据到NCBI的SRA数据库里面必须要用到,这里分享给大家。 软件名称

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标签:NCBI 日志分类:杂七杂八围观群众:250人
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