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微生物16s分析之good's coverage

发布于:18-09-14  |   作者:admin

goods coverage用于评估测序结果代表的community物种的总数【Coverage= 1 - (number of individuals in species / total number of individuals)】。在16s分析中,常用goods coverage评估测序深度是否足够(也作为subsample值得参考)。下面直接看公式: Good

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标签:16s,微生物 日志分类:微生物围观群众:197人
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singularity安装及简单实用

发布于:18-09-06  |   作者:admin

singularity是类似于docker的应用打包软件,博主使用的超算中没有需要的软件,不得不尝试使用singularity(这个服务器不支持docker)。下面记录一下首次使用的过程。 首先,在本地ubuntu 16.04上安装了singularity: $ git clone https://github.com/singula

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标签: 日志分类:学习笔记围观群众:159人
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R语言sample函数-随机采样

发布于:18-07-15  |   作者:admin

R语言中的sample()函数是用于随机采样的函数。 函数模型:sample(x, size, replace = FALSE, prob = NULL) x参数为一个向量,其中包含一个以上的元素;也可以为一个整数,如果为整数(N),采样范围为1:N,包括N本身。 size,即采样次数 replace表示是否重复

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标签:R 日志分类:学习笔记围观群众:181人
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python web开发框架推荐

发布于:18-07-06  |   作者:admin

博主用过flask、bottle和django三款python web开发框架,总体来说更喜欢django,确实在很多事情上已经帮用户搞定了。下面时转帖,留作笔记,希望有用! 1.CubicWeb CubicWeb的最重要的功能是其代码的可重用性,由一个个代码单元组成。它灵活又强大,并且还有

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标签:web,python 日志分类:Python围观群众:245人
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FASTQC: A fatal error has been detected by the Java Runtime

发布于:18-07-06  |   作者:admin

FASTQC安装错误提示: # A fatal error has been detected by the Java Runtime Environment: # # SIGSEGV (0xb) at pc=0x00007fe680eb9009, pid=23287, tid=23308 # # JRE version: OpenJDK Runtime Environment (9.0) (build 9-internal+0-2016-04-14-19524

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标签:java,FASTQC 日志分类:生信软件围观群众:178人
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