0 Comments

circos中的ticks(刻度)的绘制

发布于:13-11-12  |   作者:admin

使用circos绘制图的时候可能需要使用刻度来表示序列长度之类的,ticks标签下的参数就是来控制刻度的。在配置文件的根下(即:没有任何标签包围的区块),可以设置show_ticks参数来控制是否显示刻度。另外与之相对应的还有刻度的标签也是可以通过show_tick_la

+阅读全文

标签:circos 日志分类:杂七杂八围观群众:664人
0 Comments

从基因组可视化工具——circos说起,circos安装

发布于:13-10-19  |   作者:admin

这是博客改版的第一篇博文,选择最近使用的生物信息学软件circos开始写起。circos是用perl写的生物软件,从发表的文章来看 学习circos主要是熟悉配置文件的编辑方法,搞清楚其中的标签、参数的含义。只有完全清楚了这些东西才能够轻松自如的让circos绘制出

+阅读全文

标签:circos 日志分类:杂七杂八围观群众:6162人
0 Comments

circos绘图highlight.conf设置-绘制多层染色体圈图

发布于:13-10-14  |   作者:admin

在基因组绘图中,多层圈图是不得不提的重要内容。大多数情况下不可能只绘制一个基因组,还需要绘制其他 圈层来表达数据的内容。因此就可以使用highlight来表达。 highlight设置(重要的部分,主要用于多层全图的绘制) 1、highlights #highlight的最顶层标签

+阅读全文

标签:circos 日志分类:杂七杂八围观群众:3223人
0 Comments

dz论坛19楼风格隐藏链接处理方法

发布于:13-09-22  |   作者:admin

dz论坛使用的人不少,包括A5、28tui等大站都采用了dz。因此,这次搭建校园论坛我也选择了dz。在众多模版中我选择了19楼风格的模版,看上去非常漂亮。但是很遗憾,在使用过程中我发现我所使用的这个19楼风格模版里面暗藏某网站的外链。略懂seo的朋友都知道,

+阅读全文

标签: 日志分类:杂七杂八围观群众:82人
0 Comments

circos绘图ideogram.conf文件的配置

发布于:13-09-12  |   作者:admin

ideogram在基因组绘图中往往表示的就是染色体,在大多数情况下,ideogram是配置文件中重要的部分,也是相对参数较多的circos配置文件。主要内容包括染色体的半径、宽度、颜色,染色体排列方式以及它们之间的间隔距离等。 1、参数的含义 首先写一个范例来说明

+阅读全文

标签:circos 日志分类:杂七杂八围观群众:3050人