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MD5生成器分享,上传数据到NCBI SRA数据库必备软件

发布于:17-07-25  |   作者:admin

为了上传数据到NCB,不得不下载MD5生成器这种小众软件,结果,多年老司机在找MD5生成器这种小软件上翻了车。下载到带病毒的软件,导致电脑罢工半天。最终找到这个亲测可用的软件。考虑到上传数据到NCBI的SRA数据库里面必须要用到,这里分享给大家。 软件名称

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标签:NCBI 日志分类:杂七杂八围观群众:196人
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bam/sam格式说明

发布于:17-04-12  |   作者:admin

帮朋友处理sam各式文件,又记不住sam各式每列代表的什么内容,干脆转个帖子留着以后查询。 在SAM输出的结果中每一行都包括十二项通过Tab分隔,从左到右分别是: 1 序列的名字 2 概括出一个合适的标记

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标签:sam 日志分类:杂七杂八围观群众:4758人
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分享一个htseq-count简单修改版

发布于:17-04-12  |   作者:admin

由于做RNA-seq用到了htseq-count,出于偷懒的目的,简单修改了一下htseq-count,不用再一个个的sam文件输入文件再得到一个个独立的结果文件。修改之后可以直接以list的形式输入,再得到一个count table。 输入文件格式为一行一个输入,可以以相对路径或者绝

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标签:RNA-Seq,htseq-count 日志分类:杂七杂八围观群众:1923人
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生物信息入门,python or perl?

发布于:17-04-11  |   作者:admin

再次有朋友加我QQ问我生物信息如何入门,应该学习python还是perl。实话说,虽然已经学习生物信息三年有余,但是限于自己所处的环境以及自己的天赋,我一直认为自己并没有太大的进步。而在编程方面更是半路出家的和尚,称不上一个合格的码农,也称不上是一个p

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标签: 日志分类:杂七杂八围观群众:547人
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关于博主

发布于:16-11-21  |   作者:admin

【本着绝不吹牛,吹牛也不打草稿的原则,做简单的自我介绍】 我爸给我起名 邓飞龙 ,沿用至今,打算长期使用并刻于墓碑,属于第一批出生的90后。本科就读于雅安最强高校 四川农业大学 ,并有幸继续随迁校大军移至 成都温江 继续我的读书生涯,目前是渣渣博士

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标签: 日志分类:杂七杂八围观群众:489人
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python编程中的if __name__ == 'main': 的作用和原理

发布于:16-11-17  |   作者:admin

在大多数编排得好一点的脚本或者程序里面都有这段if __name__ == main: ,虽然一直知道他的作用,但是一直比较模糊,收集资料详细理解之后与打架分享。 1、这段代码的功能 一个python的文件有两种使用的方法,第一是直接作为脚本执行,第二是import到其他的p

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标签:python 日志分类:杂七杂八围观群众:13564人
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Soap2/ SOAPaligner短序列比对软件用法

发布于:16-10-12  |   作者:admin

Soap2/ SOAPaligner 短序列比对软件,没有提供源代码,所以只能下载对应版本,如果没有就联系官方。 Usage: 1. 下载压缩包,解压之后包含两个二进制文件,2bwt-builder 和 soap 2. 首先使用2bwt-builder对基因组建索引 2bwt-builder FastaPath/YourFasta #

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标签:soap2 日志分类:杂七杂八围观群众:1770人
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python程序打包成可执行文件

发布于:16-01-13  |   作者:admin

一年之后再用pyinstaller发现软件已经更新好多个版本,其中功能和重要参数也有新的更新,所以再重新做一下笔记,免得日后又花时间折腾。(2016.01.13更新) 目前我也正在一边学习python一边写一个小软件,看到 鸣一道 兄的博客中这篇文章,感觉很快就会用得

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标签:python 日志分类:杂七杂八围观群众:327人
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