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微生物16S rRNA NCBI RefSeq参考数据下载资源收录

发布于:2018-03-19  |   作者:admin  |   已聚集:人围观
NCBI的RefSeq 16S rRNA基因分析常用数据库,虽然数据量不大(比起RDP和silva真心小),但是人家可靠啊!种水平的blast比对常用这个数据库,目前包含19083条接近全长的16s rRNA参考序列(2018/3/13)。OTU种水平注释必备哟!!!

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参考文献:Pruitt K D, Tatusova T, Maglott D R. NCBI reference sequences (RefSeq): a curated non-redundant sequence database of genomes, transcripts and proteins[J]. Nucleic acids research, 2006, 35(suppl_1): D61-D65.
标签:微生物(4)16S rRNA(1)
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